Самоуправление в нашем городе складывалось не сразу. С 1698 по 1783 гг. Таганрог был крепостью и управлялся военной администрацией в лице выдающихся исторических деятелей, таких как Ф. М. Апраксин, К. И. Крюйс, А. Н. Сенявин. В 1769 г. было учреждено комендантство и до 1809 г. в Таганроге сменилось четыре военных коменданта: Дежедерас, Неутлинг, Касперов и Румянцев. Комендант был главным представителем администрации в городе, его власть распространялась на решение гражданских дел. Наряду с официальной властью складывались представительные формы городского самоуправления - городские магистраты: греческий и русский.
В 1802-1887 гг. в Таганроге существовало градоначальство, созданное согласно указу императора Александра I. Особую роль в развитии города сыграл градоначальник Б. Б. Кампенгаузен. В1831 г. была учреждена городская Дума. Городская реформа 1870 г. значительно повысила роль Думы. На думских заседаниях избирался городской голова, который председательствовал как в городской Думе, так и в Управе. Особый вклад в развитие городского хозяйства и культуры принадлежит городским головам А. Н. Алфераки, Н. А. Лицыну, П. Ф. Иорданову. Такая система управления городом сохранялась до 1917 г. После революции на смену Думе и Управе пришли Советы рабочих депутатов. Власть их была номинальной, реальная власть находилась в руках партийных органов. Советы просуществовали до конца 1993 г. Наибольших успехов в развитии городского хозяйства Таганрог достиг во время работы председателей горисполкома А. И. Косьмина, Б. И. Романенко. 27 марта 1994 г. состоялись первые после 1920 г. выборы депутатов городской Думы. Очередные выборы Думы походили в 1996, 2004, 2009, 2014, 2016, 2019 гг. Одним из самых принципиальных, энергичных и работоспособных депутатов последнего малого Совета Таганрогского горсовета (1993), 1-го и 2-го созывов городской Думы был А. И. Николаенко. 23 сентября 2016 г., в связи с досрочным прекращением полномочий мэра и переходом на новую систему формирования органов местного самоуправления, полномочия председателя Думы Ю. В. Стефанова были досрочно прекращены. 14 октября 2016 г. И. Н. Титаренко была избрана председателем Городской Думы - главой города Таганрога.
Городская Администрация является исполнительно-распорядительным органом городского самоуправления. В январе 1992 г. главой администрации становится С. И. Шило. В декабре 1996 г. он был избран главой городского самоуправления - мэром г. Таганрога. По решению городской Думы на весь срок своих полномочий С. И. Шило совмещал выборную должность с должностью главы администрации И. Таганрога. Благодаря своему первому мэру Таганрог уцелел и сохранился как самобытный и само-достаточный город в период, который называют «лихие девяностые». После его гибели город последовательно возглавляли К. А. Семериков, Н. Д. Федянин, В. А. Прасолов. Согласно решению городской Думы главой Администрации Таганрога с 1 ноября 2016 г. назначен А. В. Лисицкий.
В сентябре 2019 г. на первом заседании городской Думы 7-го созыва полномочия И. Н. Титаренко и А. В. Лисицкого были подтверждены.